對於自閉症的照護者來說，照顧自閉症患者吃東西往往是個難題，根據統計約有四分之三的自閉症患者非常偏食，患者對於哪些食物有偏好，哪些食物不吃的習慣經常出現：
Dominick KC, Davis NO, Lainhart J, Tager-Flusberg H, Folstein S. Atypical behaviors in children with autism and children with a history of language impairment. Res Dev Disabil. 2007;28(2):145–62. doi:10.1016/j.ridd.2006.02.003. PMID 16581226.
即使不會出現一般明顯的營養缺乏，但是跟一般人相較，腸道症狀在臨床觀察上經常出現：
Erickson CA, Stigler KA, Corkins MR, Posey DJ, Fitzgerald JF, McDougle CJ. Gastrointestinal factors in autistic disorder: a critical review. J Autism Dev Disord. 2005;35(6):713–27. doi:10.1007/s10803-005-0019-4. PMID 16267642.
小麥與牛奶的主要構成，分別為麩質與酪蛋白，對於消化功能不佳（或者功能缺陷）的人來說，麩質及酪蛋白在消化過程中無法完全分解，在腸道的產物被稱為casomorphine(有人翻譯為縮胺酸），結構類似嗎啡胜肽，經過腸道吸收進入血液，大腦會和嗎啡受器作結合，破壞大腦功能的穩定性。許多研究證實，自閉症與精神分裂症患者喝牛奶或這食用小麥製品後，其中的某些蛋白質如未完全分解，就會導致尿液的胜肽含量升高，因而出現敏感症狀，只要調整飲食，即有很大的機會獲得改善：
Reichelt KL, Knivsberg A-M, Lind G, Nødland M. Probable etiology and possible treatment of childhood autism. Brain Dysfunct. 1991;4:308–19.
在人類進化史上，牛奶及小麥屬於相當新穎的食物，推測大約在一萬年前，土耳其人首先用鐮刀來收割穀物時，人類才開始以小麥當作日常食物，在此之前，大多以各種野生植物、動物、昆蟲為食。後來農業文明從中東擴展到整個歐洲，乳牛與糧食種子隨之移入之後，許多歐洲原住民的因為缺乏與膚質敏感有關的基因，無法適應新食物的生化特性而死亡。有一些國家例如愛爾蘭，因更晚（三千年前）接觸到小麥與牛奶，因此這些食物的敏感度比其他國家居民高，例如西愛爾蘭是全球精神分裂與乳糜瀉（Celiac Disease)發生率最高的地區，一般推測與此兩種食物敏感有關。
有一位學者Dohan發現，以前東印度原住民很少有所謂的精神分裂症，但採用西式飲食、增加小麥攝取量後，敏感的情況就明顯增多了。因此不管是自閉症或者是精神分裂症，在飲食建議上，最好儘量避免乳製品及小麥這兩類食物來源。乳糜瀉的原因往往是小麥的麥膠蛋白引發，透過飲食調整，排除小麥來源的飲食，改善乳糜瀉的腸道症狀，一些疾病諸如小腦運動失調、周邊神經炎、自閉症及精神分裂症都有明顯改善：
Schuppan D, Junker Y, Barisani D (December 2009). "Celiac disease: from pathogenesis to novel therapies". Gastroenterology 137 (6): 1912–33. doi:10.1053/j.gastro.2009.09.008. PMID 19766641. http://www.gastrojournal.org/article/PIIS001650850901600X/fulltext.
功能性醫學檢測及調整對於自閉症患者改善往往有令人訝異的進展，主要就是透過功能性醫學的實驗室檢測，可以真正了解患者本身體質的問題或者缺陷所在，針對問題及缺陷，透過飲食調整、營養補充及排毒等方式來協助改善。更多資料可以參閱「六星期大腦健康計畫」及「自閉症生物療法」這兩本書的相關內容。
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