根據一份針對中年男性雙胞胎所進行的研究，服用抗憂鬱藥物的男性，動脈內膜增厚硬化、心臟病與中風的風險，高於沒有服藥的男性。

研究指出，服藥的男性，身體老化程度和沒有服藥的人相較，有高達四歲的差異。研究人員今天在紐奧良一場重要心臟病學會議上發表報告結果。

研究人員表示，這份報告創下先例，探討血管疾病和抗憂鬱藥物之間的關連。他們檢視「越戰時期雙胞胎紀錄」（VietnamEraTwinRegistry）的五百一十三對、平均五十五歲的雙胞胎。

研究人員發現，服用抗憂鬱藥物的男性，頸動脈內膜較未服藥的雙胞兄弟增厚五％。頸動脈負責提供氧氣到大腦。

喬治亞州亞特蘭大（Atlanta）艾莫瑞大學（EmoryUniversity）心臟病研究院士夏哈（AmitShah）說：「動脈內膜中層變厚（IMT）和服用抗憂鬱症藥物有明顯關連；而這種現象在正進行療程、以及較憂鬱的男性身上更為強烈。」研究指出，使用抗憂鬱症藥物讓頸動脈內膜中層增厚卅七微米，大約是五％。

在抗憂鬱的治療中，有一部份的新領域就是免疫及抗發炎的部分，包含憂鬱症、躁症以及躁鬱症等等，可能都與身體的免疫失調或者發炎有關，因此進行治療時，臨床改善強調的是抗發炎的處理：

O'Brien, SM; Scully, P; Scott, LV; Dinan, TG (February 2006). "Cytokine profiles in bipolar affective disorder: focus on acutely ill patients". Journal of Affective Disorders (Elsevier) 90 (2-3): 263–7. doi:10.1016/j.jad.2005.11.015. PMID 16410025.

 Hong, C-J; Yu, YW; Chen, TJ; Tsai, SJ (November 2005). "Interleukin-6 Genetic Polymorphism and Chinese Major Depression". Neuropsychobiology (Basel: Karger AG) 52 (4): 202–5. doi:10.1159/000089003. PMID 16244501.

另外的研究也發現因為某些疾病（包含身體的感染或者自體免疫疾病）導致壓力荷爾蒙持續釋放的結果導致細胞調節的發炎前置反應，引發神經荷爾蒙的分泌失衡，進而減少腦部細胞對於神經傳導物質的接收而發生憂鬱症現象：

Elenkov, IJ; Iezzoni, DG; Daly, A; Harris, AG; Chrousos, GP (September 2005). "Cytokine dysregulation, inflammation and well-being". NeuroImmunoModulation (Basel: Karger AG) 12 (5): 225–69. doi:10.1159/000087104. PMID 16166805.

這也可以解釋為何某些人的憂鬱症狀是發生在某些嚴重的感染疾病之後。此外，有些研究建議，未來抗憂鬱劑最好能特別著眼於免疫系統，幫助身體抑制發炎的細胞激素（cytokines)的分泌或者是幫助身體分泌抗發炎的細胞激素：

 O'Brien, SM; Scott, LV; Dinan, TG (August 2004). "Cytokines: abnormalities in major depression and implications for pharmacological treatment". Human Psychopharmacology: Clinical and Experimental (John Wiley & Sons) 19 (6): 397–403. doi:10.1002/hup.609. PMID 15303243.

由以上已經發表的研究結果，這也可以解釋為何魚油（Omega-3)這種可以幫助身體抑制發炎的天然物質可以治療憂鬱症，孩童的憂鬱大多是身體因素所引發，一項針對6-12歲的小孩做的雙盲臨床研究發現確實有療效：

 Hanah Nemetz et. al., "Omega-3 Treatment of Childhood Depression: A Controlled, Double-Blind Pilot Study", Am J Psychiatry 163:1098-1100, June 2006.

Omega-3對憂鬱症來說，的確是有幫助的，在成人的研究中，也發現吃魚較少的人，發生憂鬱症的機會較大，憂鬱症患者血液的Omega-3濃度也是比較低的：

Sontrop, J; Campbell, M (2006). "ω-3 polyunsaturated fatty acids and depression: A review of the evidence and a methodological critique". Preventive Medicine 42 (1): 4–13. doi:10.1016/j.ypmed.2005.11.005. PMID 16337677.

葉酸及維生素B12在憂鬱症的治療常被當為重要的輔助營養，這部分其實與同半胱胺酸（homocystein)濃度過高有關。以動脈硬化來說，缺乏維生素如葉酸、B₆或B₁₂的結果，同半胱胺酸水平都會上升。同半胱氨酸較高的人會容易患上血栓症及心血管疾病。最近美國的心血管研究人員針對中年的男性雙胞胎進行研究發現：

服用抗憂鬱藥物的男性，動脈內膜增厚硬化、心臟病與中風的風險，高於沒有服藥的男性。服藥的男性，身體老化程度和沒有服藥的人相較，有高達四歲的差異。服用抗憂鬱藥物的男性，頸動脈內膜較未服藥的雙胞兄弟增厚五％。

主要的研究負責人，喬治亞州亞特蘭大（Atlanta）艾莫瑞大學（EmoryUniversity）心臟病研究院士夏哈（AmitShah）說：「動脈內膜中層變厚（IMT）和服用抗憂鬱症藥物有明顯關連；而這種現象在正進行療程、以及較憂鬱的男性身上更為強烈。」研究指出，使用抗憂鬱症藥物讓頸動脈內膜中層增厚卅七微米，大約是五％。

換句話說，對於有憂鬱症困擾的人，治療若忽略身體原本的發炎（動脈硬化其實也是身體的發炎反應），直接以抗憂鬱劑來做治療，那麼產生動脈硬化的風險將明顯增加。因此，要根本治療憂鬱症，身體的發炎現象最好能夠處理，不然單純以抗憂鬱劑來治療，反而更增加動脈硬化、心臟病及中風的風險。